Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxxc1Q9CWW7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms