Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdca4Q9CWM2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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