Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms