Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
4930524J08RikQ9CUJ5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms