Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhobtb3Q9CTN4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms