Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms