Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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