Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd1Q9CR42 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd1Q9CR42 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms