Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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