Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQM1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQM1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CQM1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQM1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQM1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQM1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms