Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms