Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms