Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms