Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms