Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQC3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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