Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms