Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpa3Q9CQ71 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms