Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pole4Q9CQ36 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pole4Q9CQ36 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pole4Q9CQ36 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pole4Q9CQ36 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pole4Q9CQ36 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pole4Q9CQ36 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pole4Q9CQ36 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pole4Q9CQ36 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pole4Q9CQ36 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms