Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg3Q9CPX6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg3Q9CPX6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms