Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb1Q9CPU1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ssxb1Q9CPU1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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