Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Rpl17Q9CPR4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl17Q9CPR4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms