Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2a1Q99PM3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms