Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrbp1Q99PL5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms