Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms