Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim3Q99PE5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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