Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930550L24RikQ99PA7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms