Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsnaxip1Q99P25 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms