Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vgll1Q99NC0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms