Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms