Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atoh8Q99NA2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms