Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl3Q99N95 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms