Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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Tdrd1Q99MV1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms