Protein–RNA interactions for Protein: Q99MT2

Msh4, MutS protein homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh4Q99MT2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh4Q99MT2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms