Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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