Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms