Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp5lQ99LH9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp5lQ99LH9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms