Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms