Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms