Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q99KU6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q99KU6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q99KU6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q99KU6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q99KU6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q99KU6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q99KU6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms