Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms