Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dok4Q99KE3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms