Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfxn1Q99JR1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms