Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Kdelr1Q99JH8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdelr1Q99JH8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms