Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Def8Q99J78 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Def8Q99J78 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms