Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec3Q99J72 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms