Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan1Q99J59 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms