Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Cldn16Q925N4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Cldn16Q925N4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Cldn16Q925N4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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