Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atad3Q925I1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms