Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms