Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip1Q922J3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms